Were cells the original digital devices?{39}
This week we move on to proteins and enzymes, which means time spent with some of my favorite enzymes, protein kinases. Proteins kinases are enzymes that attach phosphate groups to other proteins. Considering the size of a typical protein, this addition of a few atoms (one phosphorous and three oxygens) does not seem like a big deal. Sort of like the little sprig of mint dressing an amazing entree at a nice restaurant. But that is not the case.. the addition of a little phosphate can have drastic consequences on the structure, and consequently, the function, of a protein molecule. An enzyme modified by a phosphorylation event may change one hundredfold or more in its activity, upward or downward, depending on what the phosphate does to the shape of the protein. The power of the phosphate resides in that one little negative charge that it carries. A few extra electrons strategically placed can change everything.
Many, many proteins are regulated by phosphorylation. Not only can the activity be affected, but also the stability, localization, substrate specificity and more. And it is not uncommon for one protein kinase to have its activity regulated by another protein kinase, which in turn is regulated by yet another protein kinase, and so on and so on and so on.
The phosphate groups are removed by opposing enzymes called protein phosphatases. We do not know nearly as much about these enzymes. I heard a fascinating seminar about an attempt to design protein phosphatase inhibitors, including inhibitors for my all time favorite phosphatase (Cdc25A – long story). There is some promise that these inhibitors might help treat a host of problems, from cardiovascular disease to cancer.
When one spends too much time thinking about kinases, phosphatases and phosphate groups, one sometimes develops the mindset that phosphorylation rules the world, or at least, rules the cell, from which all living systems are made.
Phosphorylation is a very digital event. A given amino acid in a protein is either phosphorylated or it is not. The phosphate confers a single negative charge. The subtleties and gradations arise as they might in any digital system. In a given protein, there may be multiple phosphorylation sites, some of which are occupied and some which are not in any given condition. This allows for an enzymes to be active to varying degree rather than just “on” or “off”. Or in a population of many enzyme molecules, not all may be phosphorylated at a specific site if the kinase activity is low. There are stochastic elements to be sure.
I realize this is an incredibly reductionist view and one about which I am not particularly proud, but if I can convince myself that digital devices are not scarier than the cells I know and love, then maybe I won’t be so afraid of that other cell in my life – the one called iPhone that my 8 year old daughter has to teach me how to operate.
13 Sep ’11 @ 5:45 pm
Don’t feel too bad — I am compelled to construct complete sentences in any text messages I send!
My students tease me mercilessly about my lack of acronym use to conserve motion. I then tell them the story of the electrical engineer who came to work for me who didn’t understand why I was so worried about HF — High Frequency! Oh my God (OMG — see, I know one), “no” I cried, Hydrofluoric Acid!!!
Sometimes us old folks have an advantage in knowing how to speak in complete sentences!! Ha!
19 Jan ’22 @ 10:29 am
آسیب به بیضه یکی از شایعترین آسیبهایی است که طی حوادثی مانند تصادفات وسایل نقلیه، آسیبهای ورزشی و نزاعهای فیزیکی رخ میدهد. آسیبهای داخلی کمتر اتفاق میافتد اما در صورت جدی بودن آسیب ممکن است باعث خونریزیهای شدید و آسیبهای ساختاری به همراه عفونت باشد.
19 Jan ’22 @ 11:46 am
قصد شما از ورود به این کشور چه سیاحتی باشد و چه قصد تحصیل یا کار و اقامت دائم در هلند را داشته باشید، باید جهت اخذ ویزای شینگن هلند درخواست دهید.
از سال ۱۹۹۵ که هلند به عنوان یک کشور عضو اتحادیه اروپا به عضویت منطقه شنگن درآمد، امکان درخواست اخذ ویزای شینگن هلند میسر شد.
19 Jan ’22 @ 12:40 pm
دایره های سیاه، گودیهای زیر چشم و جمع شدن رنگدانهای بافت دور چشم باعث میشود که شما خسته بنظر برسید یا اینکه دارید به شتاب پیر میشوید.
19 Jan ’22 @ 12:46 pm
دستگاه D-ACTOR 100 محصول شرکت سوئیسی STROZ میباشد که برای شکل دهی بدن، درمان سلولیت، رفع بافت اسکار و چروک پوست، بهبود الاستیسیته پوست، سفت کردن بافت همبند، درمان ترک پوستی و ناهنجاریهای پس از لیپوساکشن استفاد میشود.
19 Jan ’22 @ 12:56 pm
راز زیبایی چهره در توازن و تناسب بین اجزای صورت است. برجستهسازی چانه یک روش بسیار خوب برای زیباتر کردن و افزایش تناسب بین اجزای صورت است. چانهای که کوچک باشد یا در واقع بزرگی آن متناسب با اندازه سایر اجزای صورت نباشد، میتواند باعث نامتوازن شدن شکل کل چهره فرد شود.
https://raziclinic.ir/%d8%a8%d8%b1%d8%ac%d8%b3%d8%aa%d9%87-%da%86%d8%a7%d9%86%d9%87-%d8%a8%d8%a7-%d8%aa%d8%b2%d8%b1%db%8c%d9%82-%da%98%d9%84-%da%86%d8%b1%d8%a8%db%8c/
19 Jan ’22 @ 1:10 pm
گردن درد حاد و ناگهانی عارضه شایعی است؛ از هر سه نفر دو نفر در طول عمر خود دچار گردن درد میشوند. اکثر موارد گردن درد پیامد ابتلا به بیماری جدی یا مشکلات گردن نیست و غالباً علت دقیق گردن درد واضح نیست از این موارد با اصطلاح گردن درد غیراختصاصی یاد میشود. اکثر موارد گردن درد ناشی از حالت اندامی نامناسب یا کشیدگی و آسیبدیدگی عضلات و رباطها است. گردن درد اکثر بیماران به طور کامل بهبود مییابد. توصیه مفیدی که به بیماران میشود، این است که گردن را در دوران حمله گردن درد فعال نگه دارند و تا زمان برطرف شدن درد مسکن مصرف کنند. درد برخی بیماران مزمن یا مداوم میشود و انجام درمانهای بیشتر را ضروری میسازد.
8 Oct ’19 @ 9:34 am
It’s hard to come by experienced people about this subject, but you seem like you know what you’re talking about! Thanks
Pinoy Tv Lambingan Show
8 Oct ’19 @ 9:39 am
The next time I read a blog, I hope that it does not fail me just as much as this particular one. I mean, I know it was my choice to read, nonetheless I actually believed you would probably have something useful to talk about. All I hear is a bunch of whining about something you could fix if you were not too busy looking for attention.
Lambingan Tv Show
10 Nov ’19 @ 6:28 pm
astropay
17 Jan ’20 @ 8:48 pm
We are the company of online service providers for computer and electronics types of equipment. If you need any kind of help you with promoting your business online and computer repair service. If you want to Install or setup Arlo camera, then please read the blog on our website.
14 Feb ’21 @ 6:34 pm
Thanks to Admin of post for such great information. I like your blog post and subscribe your blog for all your future post. Thank You Altadefinizione 2020
14 Feb ’21 @ 6:36 pm
The Pinoy TV shows and programs that are aired on Pinoy TV make you proud to be a part of Philippines culture. People also love to watch all Pinoy teleserye of pinoy lambingan
14 Feb ’21 @ 6:37 pm
The Pinoy TV shows and programs that are aired on Pinoy TV make you proud to be a part of Philippines culture. People also love to watch all Pinoy teleserye of pinoy lambingan
22 Feb ’21 @ 9:54 am
I wish I had found this blog before. The advice in this post is very helpful and I surely will read the other posts of this series too. Thank you for posting this. You have a very good site, well constructed and very interesting I have bookmarked you hopefully you keep posting new stuff. Aol Error 301
6 Mar ’21 @ 6:25 am
Doing gets! Goodness! Goodness! What a thought, man! Confounding centrality of! Wavering. If you have some problem with HP Error Code 0x83c0000a click the link.
6 Mar ’21 @ 3:16 pm
ساکن هر کجای تهران که هستید با شعب ما در منطقه خودتان تماس بگیرید . لوله بازکنی شهر زیبا ارزان و فوری تخصص خدمات فنی سماء است .
7 Mar ’21 @ 1:14 pm
Thanks for nice post…lovley and swet
25 May ’21 @ 5:29 am
thanks for approved my comment pinoyflix
12 Aug ’21 @ 11:21 am
Watch latest and full episodes of your favourite Star Vijay TV Serial online on Disney+ Hotstar, the one-stop destination for popular Star Vijay serials …
12 Aug ’21 @ 12:17 pm
تخلیه چاه و لوله بازکنی فلاح از مهم ترین خدمات ارائه شده توسط تیم خدمات فنی تهران می باشد که با شیوه های کاملا بروز و استاندارد قابل انجام می باشد.
24 Aug ’21 @ 10:55 am
Get Here the Today Latest Result of Swertres 3D, EZ2 (2D), STL 2PM, 5PM and PM Draws also With 6/58, 6/49, 6/45, 6/55, 6/42 PCSO Lotto Results. We are Providing you the On-Time Result Updates of Philippines Daily lotto Result. Visit my Website Pcsolottoresultz.com
28 Aug ’21 @ 9:41 am
Wow! Amazing great thanks for sharing
17 Sep ’21 @ 7:38 am
With sublimation printers, you can create quality business cards, banners, signs & more without worrying about colors or images fading. With our specialized software, you can easily print photos for your loved ones, family portraits, your company’s logo, and much more! https://shakespearefound.org.uk/
20 Nov ’21 @ 8:19 pm
토토안전사이트
19 Dec ’21 @ 11:01 am
Welcome to Pinoy Teleserye Tambayan, Watch your favorite Pinoy Tambayan, Pinoy Tv Shows, Pinoy Teleserye, Pinoy Flix, Pinoy Tv Channel Online
17 Jan ’22 @ 1:29 pm
Watch Online Lambingan Tv Shows For All Episode In HD Quality Pinoy Tv, Pinoy Teleserye, PinoyFlix, Pinoy Tambayan Provide On Our Pinoylambinganph.su!
18 Jan ’22 @ 5:09 pm
Watch your favourite Pinoy Teleserye, Pinoy Tambayan, Pinoy Channel, Teleserye Replay, Pinoy TV Series and Pinoy TV Shows online for free On PinoyTV.
19 Jan ’22 @ 7:25 am
از آنجا که این عمل به جای بیهوشی عمومی در حالت هوشیاری و با استفاده از بیحسی موضعی انجام میشود، معمولاً احتیاج به بستری شدن طولانی مدت در بیمارستان ندارد.
علاوه بر این، در این روش جراحی هیچ برشی ایجاد نمیشود. از آنجا که این عمل با استفاده از یک سوراخ کوچک در سطح پوست انجام میشود، نیازی به شکافتن بدن و بخیه نیست. بیمار همچنین میتواند مدت کوتاهی پس از انجام عمل، فعالیتهای عادی خود را از سر بگیرد.
19 Jan ’22 @ 8:53 am
نرمی کشکک زانو اختلالی است که تحت عنوان نرم شدن و تحلیل رفتن غضروف زانو توصیه میشود. نرمی کشکک زانو عبارتی است که گاهی با سندروم درد پاتلوفمورال همسان در نظر گرفته میشود اما سندروم درد پاتلوفمورال عبارتی است که فقط برای افرادی به کار میرود برده میشود
19 Jan ’22 @ 9:09 am
پوکی استخوان نوعی بیماری است که استخوانهای شما نازک، شکننده و ضعیف میشوند و در نتیجه احتمال شکستگی (ترک خوردگی) نسبت به استخوان طبیعی بیشتر است. پوکی استخوان زمانی اتفاق میافتد که کلسیم بیشتری از مقدار کلسیم وارد شده از استخوانهای شما خارج شود. این امر منجر به کاهش تراکم استخوان یا ایجاد حالتی به نام “لانه زنبوری” در استخوان شما میشود. درمان پوکی استخوان شامل کاهش هر یک از عوامل موثر در ضعف سلامت استخوان است. پزشک شما ممکن است به شما توصیه کند که رژیم فعلی ورزش را ارتقا دهید، داروهای خود را به صورت مرتب مصرف کنید یا عوامل فعلی سبک زندگی را که شما را مستعد پوکی استخوان میکند، تغییر دهید.
19 Jan ’22 @ 10:06 am
مفصل شانه برای بسیاری از افراد ناشناخته است. در واقع شانه از دو مفصل جداگانه تشکیل شده است، به این معنی که قسمتهای زیادی وجود دارد که در آن درد ایجاد میشود.
19 Jan ’22 @ 10:20 am
اورولوژیست به متخصصی گفته می شود که مردان، زنان و کودکان را درمان می کند. بیماران این متخصص معمولاً با مشکلات کلیوی، مثانه، پروستات و مشکل آلت های تناسلی مردانه دست و پنجه نرم می کنند. این شرایط شامل سرطان، سنگ کلیه، عفونت، از دادن کنترل، اختلالات جنسی و مشکلات کف لگن می باشد.
19 Jan ’22 @ 11:15 am
هنگامی که صحبت از کیفیت در آموزشی عالی، هزینههای تحصیلی پایین، زیرساختهای تحقیقاتی، چشمانداز شغلی و روشهای تدریس در سطح جهانی میشود، نام کشور آلمان به ذهن خطور میکند. آلمان، که در بین دانشجویان به تحصیلات دانشگاهی رایگانش شناخته میشود، پرطرفدارترین مقصد تحصیلی در میان کشورهای غیرانگلیسی زبان است. نرخ پذیرش ویزای دانشجویی آلمان 92% بوده و از آمریکا (80%) و انگلیس (85%) بیشتر است.
ادامه
19 Jan ’22 @ 11:47 am
قصد شما از ورود به این کشور چه سیاحتی باشد و چه قصد تحصیل یا کار و اقامت دائم در هلند را داشته باشید، باید جهت اخذ ویزای شینگن هلند درخواست دهید.
از سال ۱۹۹۵ که هلند به عنوان یک کشور عضو اتحادیه اروپا به عضویت منطقه شنگن درآمد، امکان درخواست اخذ ویزای شینگن هلند میسر شد.
19 Jan ’22 @ 11:49 am
قصد شما از ورود به این کشور چه سیاحتی باشد و چه قصد تحصیل یا کار و اقامت دائم در هلند را داشته باشید، باید جهت اخذ ویزای شینگن هلند درخواست دهید.
از سال ۱۹۹۵ که هلند به عنوان یک کشور عضو اتحادیه اروپا به عضویت منطقه شنگن درآمد، امکان درخواست اخذ ویزای شینگن هلند میسر شد.
19 Jan ’22 @ 12:32 pm
کمر درد یکی از عوارض رایج دوران بارداری است. حدود یک دوم تا سه چهارم بانوان باردار در مقطعی از این دوران دچار کمردرد میشوند. خوشبختانه روشهای بسیاری برای تسکین کمر درد بارداری و پیشگیری از تبدیل شدن آن به مشکلی مزمن وجود دارد. چنانچه در دوران بارداری دچار کمردرد شدید، نگران تاثیر آن بر زایمانتان نشوید. چنانچه تحت درمان مناسب قرار بگیرید، بعید است که کمر درد مشکلی را برای وضع حملتان ایجاد کند. حتی برخی بانوان که پیش از بارداری دچار کمر درد بودهاند، در دوران بارداری با این درد خداحافظی میکنند.
10 Feb ’22 @ 8:48 pm
Pretty! This was a really wonderful post.
27 May ’22 @ 7:31 am
Very informational Blog about Simple Life.Thanks for sharing Your